「花宅」名稱最早見於1684年(清康熙23年)杜臻所著《澎湖臺灣紀略》:「八?之旁澳嶼甚多…在西者曰大花宅、小花宅…」。根據在地耆老表示,聚落周邊由層層狀如花瓣的丘陵所包圍,社里中央則有一座隆起高地(俗稱山仔尾)形似花朵心蕊,因之得名。由於聚落西側鄰海,與海中花嶼相望,高拱乾成於1694年的《臺灣府志》卷一〈封域志〉則有另外一種說法:「大花宅澳,在八罩嶼南。旁曰小花宅澳。二澳與花嶼拱照,故名花宅。」

日本時代行政區劃依然沿用花宅名稱,戰後1946年方被改名望安鄉「中社」村,然而迄今澎湖民眾日常對話仍以台語「花宅」稱之。